6-FAM phosphoramidite
CAS#:204697-37-0
中文名:6-FAM 亚磷酰胺单体
分子式:C46H58N3O10P
分子量:843.94
将 6-FAM phosphoramidite 连接到Oligo
1. 用干燥的乙腈溶解6-FAM phosphoramidite(乙腈中水的含量< 30ppm)。
2. 在PE™ 8900 这台仪器上,加2mL 乙腈到0.1g 6-FAM phosphoramidite中,得到的浓度为50mg/mL。在 PE 390系列仪器上,加 1.2mL乙腈 到0.1g 6-FAM phosphoramidite 得到 0.1M 的溶液。
3. 轻轻晃动小瓶,直到固体粉末完全溶解。然后放在DNA合成仪上,可以使用三天。
4. 输入Oligo的合成序列,6-FAM phosphoramidite标记在 5’端,标记时间至少是3分钟。
5. 标准的DNA oligo合成操作。6-FAM phosphoramidite不含有DMT基团,只能在最后一步标记在5’端终止反应。
6. 用氨水在55°C ,8小时对oligo进行脱保护。
7. 已标记的oligo可以进一步处理,例如脱盐,用HPLC或者 PAGE纯化。纯化过程中FAM标记的oligo因为有颜色所以非常容易收集。
8. 标记的Oligo要避光保存。